همایون شجریان در ۳۱ اردیبهشت ۱۳۵۴ در تهران در خانوادهای اهل موسیقی متولد شد.همایون شجریان فرزند محمدرضا شجریان و برادر کوچک مژگان شجریان است. همایون شجریان در سال ۱۳۷۵ با گیتا خوانساری ازدواج کرد که حاصل این ازدواج فرزندی به نام یاسمین است.چند سالی است در فضای مجازی، خبر ازدواج سحر دولتشاهی و همایون شجریان دست به دست میشود. این دو هنرمند کشور تا کنون به این موضوع واکنش نشان ندادند و خبر رسمی ازدواج خود را اعلام نکردند ولی آنها در اکثر مکانهای عمومی و خصوصی با یکدیگر دیده شدهاند و شکار دوربین عکاسان شدهاند.همچنین سحر دولتشاهی در روز خاکسپاری استاد شجریان در کنار همایون شجریان ایستاده بود و در آخر در ماشین وی سوار شد. همچنین سحر دولتشاهی بارها عکس کودکی همایون شجریان را استوری کرده و اخیرا با او و دخترش یاسمن به عراق سفر کرد.